Белок Rad50
Gene: [05q31/RAD50] RAD50 (S. cerevisiae) homolog
Rad50 и Mre11 , но не Nbs1 (или Xrs2 дрожжей) обнаружены у представителей всех царств живых организмов ( Aravind и др., 1999 ), что предполагает формирование Rad50/Mre11 основы комплекса DSBR .
Rad50 обладает ATP-зависимой ДНК-связывающей и частичной ДНК-расплетающей активностями ( Raymond и Kleckner, 1993 ; Paull и Gellert, 1999 ), а для dsДНК-экзонуклеазной активности гомологов E. coli SbcC/SbcD необходим ATP ( Connelly и др., 1997 ). Мутации в нуклеотидсвязывающем мотиве Rad50 дрожжей обладают нулевым фенотипом по DSB-репарации и мейозу, что предполагает существенность связывания ATP и/или гидролиза in vivo, поскольку некоторые мутации в районе нуклеотидсвязывающего участка (именуемых для разделения функций rad50S) приводят к нарушениям мейотических, но не митотических DSBR ( Alani и др, 1990 ).
Таким образом, понимание основной роли Rad50 в мейозе и DSBR требует рассмотрения ATP-зависимости активности Rad50.
Белок Rad50 массой 150 кДа представляет собою последовательность ATP-связывающего/каталитического домена (Rad50cd) , прерываемого гептаповтором, обладающим длиной от 600 до 900 а.о. N- концевой мотив Уолкера A и С-концевой мотив Уолкера B фланкируют повтор ( Walker и др., 1982 ). Архитектура последовательности характеризует структурную организацию хромосомного семейства SMC ( Strunnikov и Jessberger, 1999 ; Holmes и Cozzarelli, 2000 ) и предполагает, что антипараллельная сборка молекул Rad50 приводит к созданию двух Rad50cd , соединенных двойной спиралью ( Saitoh и др., 1995 ; Melby и др., 1998 ).
