Белки SMC и конденсация хромосом
Основанное на структуре выравнивание последовательностей ( Рис 3 ) позволяет отнести белки SMC к надсемейству АВС-ATPаз , принимая во внимание ATP-управляемую димеризацию каталитических доменов SMC-белка. Что соотносится с двумя современными моделями конденсации хромосом ( Kimura и др., 1999 ; Sawitzke и Austin, 2000 ). В первой модели, согласно которой белки SMC собираются вдоль ДНК и индуцируют общее скручивание ( Kimura и др., 1999 ), полученные на Rad50 результаты свидетельствуют об ATP-управляемой ассоциации двух каталитических доменов соседних молекул. Во второй модели, согласно которой белки SMC концентрируютя вокруг своего главного домена ( Kimura и др., 1999 ), полученные на Rad50 результаты предполагают, что ATP способствует сборке двух каталитических доменов одной молекулы ( Рис 6 ). Таким образом, эти данные обеспечивают детально разработанную базу для проверки механизмов управления конденсацией хромосом посредством белков SMC.
Rad50:
структура ATP-связанного димераRad50cd
домен
Rad50 Pyrococcus furiosis (pf) в
DSBR: исследование функции и структуры
Консервативные и функциональные мотивы Rad50 и NBD CTFR