Белковый домен: ДНК-связывающий: Zn-фингерный
Это очень распространенный домен ДНК связывающих факторов. Говорят о двух типах таких доменов. Один из них содержит в аминокислотной последовательности длиной около 30 аминокислот два цистеиновых и два гистидиновых остатка. Такое сочетание называют С2Н2 мотивом . Эти аминокислоты стабилизируют вторичную структуру домена, образуя комплекс с ионом цинка Zn +2 . Этот комплекс затем специфически взаимодействует с определенными последовательностями ДНК в ее большой бороздке .
Чаще всего факторы содержат не один, а несколько Zn-фингерных доменов. Фактор транскрипции Sp1 , который связывается с GC-боксом ( Рис. 4 svtr ) содержит в своем составе такие домены.
Такие цинкфингерные белки, как полагают, связываются со своими мишенями на ДНК в мономерном виде.
Другой тип домена содержит четверку цистеинов, которые также связывают цинк. Такой домен можно найти в глюкокортикоидном рецепторе . Его называют С4 мотиво м. Множество факторов, содержащих различн Zn-фингерные домены, узнают самые разные последовательности ДНК. Это связано с тем, что последовательности самих доменов и окружающих их участков различны. Консервативны только общие контуры домена.
