Прокаспаза 9: активация
Активация прокаспазы 9 осуществляется цитоплазматическим фактором активации протеаз апоптоза APAF-1 [ Rodriguez ea 1999 ]. APAF-1 играет роль каркаса, на котором происходит аутокаталитический процессинг каспазы 9. Предполагается, что в результате конформационного изменения белковой молекулы APAF-1 приобретает способность связывать цитохром C . Дальнейшие конформационные изменения приводят к взаимодействию между CARD-доменом (caspase activation and recruitment domain) APAF-1 и CARD- доменом прокаспазы 9 . Образуется апоптосома с молекулярной массой 1,3 млн. Да, в состав которой входит не менее 8 субъединиц APAF-1 [ Rodriguez ea 1999 ]. Прокаспаза 9 затем связывает прокаспазу 3 . Пространственное сближение молекул прокаспазы 9 и 3 на мультимерной структуре из APAF-1-цитохром-с комплексов , по-видимому, приводит к межмолекулярному протеолитическому процессингу прокаспазы 9 с образованием активной каспазы 9 .
APAF-1 играет роль арматуры, на которой происходит аутокаталитический процессинг каспазы 9 [ Zou, ea 1999 , Hu, ea 1999 , Adrain, ea 1999 ]. Предполагается, что в результате зависимого от гидролиза dATP (или ATP ) конформационного изменения APAF-1 приобретает способность связывать цитохром с. Связав цитохром с, APAF-1 претерпевает дальнейшее конформационное изменение, способствующее его олигомеризации и открывающее доступ CARD-домена APAF-1 для прокаспазы 9, которая тоже содержит CARD-домен. Так образуется конструкция, называемая тоже апоптосомой , с молекулярной массой более 1,3 млн дальтон, в составе которой - не менее 8 субъединиц APAF-1 [ Zou, ea 1999 ]. Благодаря гомофильному CARD-CARD-взаимодействию с APAF-1 в эквимолярном соотношении связывается прокаспаза 9 , а затем прокаспаза 9 связывает прокаспазу 3 . Пространственное сближение молекул прокаспазы 9 и 3 на мультимерной структуре из APAF-1-цитохром-с комплексов , по-видимому, приводит к межмолекулярному протеолитическому процессингу прокаспазы 9 с образованием активной каспазы 9 . [Zou, ea 1999 , Hu, ea 1999 , Adrain, ea 1999 ].
Существует и другой вариант активации каспазы 9 - прокаспаза 9, связанная с апоптосомой, может принять конформацию, которая приводит к внутримолекулярному процессингу (самоактивации) [ Salvesen ea 1999 ].
Зрелая каспаза 9 затем расщепляет и активирует прокаспазу 3.
Предложен механизм для активации прокаспазы CED-3 у червя Caenorhabditis elegans [ Yang, ea 1998 ] - аналога прокаспазы 9 млекопитающих. Альтернативный вариант -прокаспаза 9, связавшись с апоптосомой, может принять конформацию, которая приводит к внутримолекулярному процессингу (самоактивации) [ Hu, ea 1999 ]. Зрелая каспаза 9 затем расщепляет и активирует прокаспазу 3 .
