Trans-нуклеарное сравнение геномов, опосредованное РНК-интерференцией
Trans-нуклеарное сравнение целых геномов, опосредованное РНК-интерференцией.
Зависящие от гомологии эффекты, описанные выше (см. " ПОДАВЛЕНИЕ ЭЛИМИНАЦИИ IES В МАКРОНУКЛЕУСЕ ИНФУЗОРИЙ "), демонстрируют существование "переговоров" [a cross talk] между материнским соматическим геномом и геномом зародышевой линии в процессе ядерной дифференцировки, которые могут существенным образом менять паттерны перестройки ДНК. Тот факт, что затрагиваются только высоко гомологичные последовательности, является сильным аргументом в пользу предположения, что эти "переговоры" опосредуются нуклеиновыми кислотами. В этом регуляторном механизме могли бы, возможно, участвовать транскрипты из материнского макронуклеуса, экспортируемые в развивающийся макронуклеус, где, в случае, если они содержат IES , они предотвращали бы элиминацию гомологичных последовательностей. Однако было показано, что эти предполагаемые материнские транскрипты не участвуют в качестве донорских матриц в ходе репарации двунитевых разрывов, индуцируемых конститутивной эксцизией IES ( Duharcourt et al., 1995 ). Если материнские защитные транскрипты существуют, эти приблизительно 23-нуклеотидные siRNAs , которые диктуют сайленсинг генов , могут косвенным образом "нацеливать" делецию ДНК, стимулируя разрушение тех из них, которые идентичны по последовательности. Сама по себе эта роль siRNAs не может объяснить материнское наследование перестроечных паттернов в последовательных поколениях. Как это обсуждается ниже, возможно, что в конечном счете реорганизацией генома управляет взаимодействие между материнскими макронуклеарными транскриптами и новым классом коротких РНК, происходящих из мейотического микронуклеуса.
