Варианты H2A с неизвестными функциями
Другие варианты Н2A дифференцируют хроматин, но их функции все еще неизвестны.
Дальнейшая диверсификация Н2A произошла у позвоночных. У млекопитающих macroH2A и H2ABbd (Н2A Barr body deficient) представляют уникальные линии, которые, по-видимому, играют роль в эпигенетическом феномене компенсации дозы (детально обсуждается в главе " Компенсация дозы у млекопитающих "). MacroH2A называется так потому, что, кроме домена histone fold и карбокситерминальных " хвостов ", он содержит большой карбокситерминальный глобулярный домен ( Ladurner, 2003 ). С учетом того, что карбокситерминальный "хвост" Н2A выходит поблизости от линкерной ДНК, возможно, что этот глобулярный домен взаимодействует с линкерами, "хвостами" НЗ или с такими линкерными белками, как H1 и белки HMG (High Mobility Group). В чем именно заключается это взаимодействие - неизвестно, хотя интригующая возможность заключается в том, что оно обладает ферментативной активностью. В пользу этой возможности говорит сходство глобулярного домена (имеющего длину в 200 аминокислотных остатков) с белками, обладающими гидролитической активностью по отношению к полинуклеотидам и полипептидам. Другая возможность заключается в том, что глобулярный домен может просто действовать как препятствие для инициации транскрипции; на мысль о такой роли наводит его способность блокировать связывание транскрипционных факторов in vitro ( Sarma and Reinberg, 2005 ). Домен histone fold macroH2A также обладает специфическими свойствами, поскольку он не действует на ремоделеры хроматина . Эти наблюдения позволяют предполагать, что нуклеосомы, содержащие macroH2A, менее мобильны и потому могут быть устойчивыми к активной транскрипции. Это могло бы объяснить обогащенность дискретных районов факультативно неактивной Х-хромосомы вариантом macroH2A у женщин - районов, которые чередуются с участками конститутивного гетерохроматина ( рис. 13.9 а) ( Chadwick and Willard, 2004 ).
В противоположность macroH2A H2ABbd, по-видимому, не выявляется на тельце Бара , но в остальном наблюдается повсеместно в ядре ( рис. 13.9 б) ( Chadwick and Willard, 2001 ). Поведение in vitro нуклеосом, содержащих H2ABbd, согласуется с предположением, что он играет роль в облегчении транскрипции ( Sarma and Reinberg, 2005 ). H2ABbd является быстро эволюционирующим белком по сравнению с другими известными изоформами Н2A , хотя причины этой ускоренной эволюции неясны.
