Грибы как модельные организмы для эпигенетических исследований
Грибы дают нам превосходные модели для понимания структуры и функции хроматина как в активно транскрибируемых районах ( эухроматин ), так и в транскрипционно "молчащих" районах ( гетерохроматин ). Почкующиеся дрожжи, Saccharomyces cerevisiae , явились бесценной эукариотической моделью для изучения структуры хроматина, связанной с транскрипцией в эухроматиновых районах, и для создания парадигмы для "молчащего" хроматина. С другой стороны, дробянковые дрожжи Schizosaccharomyces pombe и нитчатый гриб Neurospora crassa явились эффективным средством для исследования форм сайленсинга , более тесно связанных с таковыми у высших эукариот. У этих грибов гетерохроматиновые районы сравнительно малы и несущественны для жизнеспособности, что делает их более легкими для расчленения [to dissect] и манипулирования. Наше понимание гетерохроматина вокруг центромерных и теломерных районов достигло наибольших успехов в работе с дрожжами S. cerevisiae и S. pombe; однако механизм сайленсинга хроматина, используемый S. pombe, демонстрирует особенности, консервативные и у этих дрожжей, и у гетерохроматиновых районов высших эукариот. Действительно, оба гриба, обсуждаемые в этой главе, - N. crassa и S. pombe - контрастируют с S. cerevisiae в том отношении, что они используют РНК-интерференцию ( RNAi ), метилирование гистона НЗ по лизину 9 и белки типа белка 1 гетерохроматина ( НР1 ) для формирования "молчащего" гетерохроматина способом, который консервативен или сходен с таковым у растений и многоклеточных животных. Кроме того, N. crassa широко использует метилирование ДНК , являющееся характерной чертой гетерохроматина у многих высших эукариот и классическим эпигенетическим феноменом.
