Метилирование H3K36
Полученные данные привели к предположению, что метилирование H3K36 необходимо для эффективной элонгации RNA pol II через кодирующий участок. Кодирующий район активных генов очень обогащен этой модификацией в противоположность 5'-локализации метилирования НЗК4. Белок Set2 является НКМТ , способной метилировать H3K36. Фермент Set2 связывается предпочтительно с RNA pol II, которая была фосфорилирована по Ser-2 в пределах его CTD ( рис. 10.5 ). Эта форма RNA pol II, которая, между прочим, отличается от фосфорилированного состояния, связанного с очисткой промотора, имеет тенденцию аккумулироваться в транскрибируемых районах так же, как на З'-концах генов. Это согласуется с тем, что НЗКЗ6mеЗ достигает пика на З'-концах генов, которые активно транскрибируются. Рекрутирование Set2 к активным генам требует также компонентов комплекса PAF , как в случае рекрутирования Set1. Однако моноубиквитилирование Н2В играет негативную репрессивную роль в метилировании H3K36 ( Zhang and Reinberg, 2001 ; Martin and Zhang, 2005 ). Действительно, комплекс SAGA , рекрутируемый к транскрибируемым генам у дрожжей, содержит Ubp8, деубиквиназу , которая специфична к Н2ВК123. Дальнейшие исследования позволили предположить, что убиквитилирование и деубиквитилирование Н2ВК123 являются активным процессом в ходе транскрипционной элонгации.
Продвижение RNA pol II через кодирующие участки требует ацетилирования нуклеосом. Транскрипционное регулирование также нужно для подавления неправильной внутренней инициации транскрипции с криптических стартовых сайтов, которые встречаются внутри кодирующих районов. Чтобы подавить этот процесс, метилирование по H3K36 с помощью Set2 создает сайт узнавания для белка EAF3 через его хромодомен , который в свою очередь опосредует рекрутирование комплекса Rpd3S HDAC . Деацетилазная активность Rpd3S удаляет затем ацетилирование гистонов, связанное с элонгацией, супрессируя таким образом внутреннюю инициацию ( Carrozza et al., 2005 ; Joshi and Struhl, 2005 ; Keogh et al., 2005 ). Метилирование H3K36 также оказалось на гораздо более низком уровне в промоторах индуцибельных генов, но в этом случае его влияние оказывается репрессивным ( Zhang and Reinberg, 2001 ).
