Антисмысловые РНК прокариот природные
В прокариотических системах антисмысловые РНК участвуют в регуляции репликации и поддержании плазмид .
Инициация репликации плазмиды ColEI негативно регулируется с помощью короткой, нетранслируемой антисмысловой РНК. Механизмы с участием антисмысловых РНК используются для регуляции репликации плазмид группы IncF1 (NR1, R1 и R6) и IncQ (R1162) , а также для регулирования числа копий плазмиды pT181 Staphylococcus aureus.
Антисмысловые РНК служат у бактерий для регуляции экспрессии генов на уровне транскрипции (например, гена белка-рецептора циклического АМР ) и трансляции. В последнем случае антисмысловая РНК micF участвует в подавлении экспрессии белка OmpF внешней мембраны E. coli.
Экспрессия гена sulA E. coli , кодирующего SOS-индуцируемый ингибитор деления бактериальных клеток, регулируется нетранслируемой РНК, комплементарной на протяжении 250 нуклеотидов 3'-концевой части sulA-РНК.
Регуляция на уровне трансляции антисмысловыми РНК имеет место у колицинового (E1) оперона плазмиды ColEI , а также оперона gvpABC цианобактерии Calotrix 7601, которые обеспечивают образование газовых везикул, придающих плавучесть бактериальным клеткам.
Антисмысловые РНК участвуют и в регуляции жизненного цикла бактериофагов. Например, у бактериофага лямбда обнаружена короткая антисмысловая РНК, комплементарная мРНК гена Q и ингибирующая ее трансляцию. Это приводит к понижению уровня экспрессии поздних генов бактериофага и ингибированию его литического развития. Другой антисмысловой РНК фага лямбда, участвующей в регуляции экспрессии гена сII-репрессора , является opРНК. Эта РНК комплементарна 3'-концевой части транскрипта гена cII и после образования гибрида ингибирует ее трансляцию, вероятно, вследствие расщепления дуплекса РНКазой III клетки-хозяина. Небольшая антисмысловая РНК (sarРНК) участвует в регуляции синтеза антирепрессора фага P22. Та же система регуляции антисмысловых РНК характерна и для некоторых транспозонов .
