LINE (long interspersed elements) ДНК повтор

LINE-последовательности заключают в себе гены обратных транскриптаз, что является признаком ретротранспозонов (мобильных генетических элементов животных, обладающих структурным сходством с геномом ретровирусов ), но для них характерно отсутствие последовательностей длинных концевых повторов ( LTR - long terminal repeats), типичных для ретротранспозонов. В качестве примера LINE-последовательности можно упомянуть LINE1 повтор мыши и L1-повтор человека.

Длинные повторы изначально были описаны как последовательности ДНК длиной более 5 kb и представленные более чем 104 копиями на геном ( Singer, 1982 ). В геноме человека было обнаружено только одно семейство повторов LINE - L1 ( Hutchison et al, 1989 ). Консенсусная последовательность этих повторов имеет длину около 6 kb, так называемый poly-A "хвост" на одном конце и фланкирована короткими прямыми повторами обычно менее 20 н.п. длиной. Число копий - примерно 100,000 на гаплоидный геном. Большинство этих повторов усечены на 5'-конце.

Ссылки: