OGGII, AGOG архейные 8-оксигуанин-ДНК-гликозилазы

В некоторых видах архей обнаружены ферменты, способные выщеплять из ДНК остатки 8-oxoGua и содержащие консервативные мотивы HhH и GPD, но в остальном не гомологичные эукариотической 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазе OGG1 . Первый из таких белков был обнаружен в M.jannaschii при сравнении выровненных последовательностей, содержащих мотивы HhH и GPD; было показано, что продукт клонированного гена преимущественно выщепляет из поврежденной ДНК окисленные пурины [ Gogos, ea 2000 ]. Белок получил название OGGII [ Denver, ea 2003 ], что вносит некоторую терминологическую путаницу в обозначения ДНК-гликозилаз, поскольку ранее был описан белок yOGG2 (он же yNTG1) из S.cerevisiae (разд. OGGI ). В P.aerophilum была описана еще одна 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаза ( AGOG, archaeal 8-oxoGuanine-DNA glycosylase ) Nth суперсемейства . Этот белок содержит атипичные мотивы HhH и GPD, в которых длина второй спирали и GPD-петли почти вдвое превышает длину этих структурных элементов в других ДНК-гликозилазах [ Sartori, ea 2004 , Lingaraju, ea 2005 ]. Фермент Pae-AGOG с одинаковой эффективностью выщепляет 8-oxoGua из пар с Cyt и Gua и обладает слабой AP-лиазной активностью [ Sartori, ea 2004 ].

Ссылки: