G-квартет
Поперечное сечение квадруплекса (четырехнитевой структуры), как правило, образовано четверкой гуаниновых нуклеотидов - G-квартетом. Каждое гуаниновое основание в G-квартете образует водородные связи с двумя соседними основаниями. Обычно в составе квадруплекса присутствуют 2-3 расположенных подряд G-квартета. Подобные структуры обладают очень высокой стабильностью по сравнению с более простыми структурными мотивами. Дополнительная стабилизация квадруплекса происходит в присутствии ионов K+, которые координируются между плоскостями двух соседних G-квартетов ( Jing et al., 1997 ).
G-квартетные структуры оказались наиболее характерны для ДНК-аптамеров, хотя в некоторых случаях они были найдены и в РНК-лигандах ( Bock et al., 1992 ; Kulbachinskiy et al., 2004 ; Shi et al., 1997 ; Tasset et al., 1997 ; Weiss et al., 1997 ; Wen and Gray, 2002 ). Предполагается, что во всех случаях структурный мотив G-квартета служит архитектурной основой аптамера, а в узнавании белка участвуют нуклеотиды в вариабельных петлях, расположенных между тяжами квадруплекса.
