Белки ядерные: экспорт, NES-зависимый механизм
Некоторые белки транспортируются из ядра по энергозависимому механизму. В первую очередь это компоненты РНК-транспортирующих систем . У этих белков была определена специфическая последовательность - NES (nuclear export signal) . Эта последовательность, характеризующаяся положениями гидрофобных остатков, в первую очередь лейцина и изолейцина, связывается со специфическим ядерным рецептором CRM1. Еще один важный момент - это экспорт из ядра нечаянно попавших туда белков. Такое может случиться за счет диффузии или при постмитотической сборке ядерной оболочки. Для решения этой проблемы сигналы ядерного экспорта должны нести все цитоплазматические белки. К сожалению, NES не настолько характерная последовательность как NLS . Лейцин и изолейцин очень широко распространенные аминокислоты, и в составе сигнала они располагаются не подряд, поэтому глядя на сиквенс, сигнал ядерного экспорта можно действительно найти во многих белках. Но при проверке, похожая на сигнал последовательность совсем не всегда оказывается сигналом. Впрочем, для самого широко представленного в клетке белка - актина , с помощью сайт-направленного мутагенеза, были определены два предположительных сигнала экспорта - ( 170ALPHAIMRLDLA181 ) и ( 211DIKEKLCYVALD222 ) ( Wada, A. et. al. 1998 ).
NES-зависимый экспорт субстратов может служить также и для регуляции. В качестве примера можно назвать систему PKA (cAMP-dependent protein kinase) - PKI (protein kinase A inhibitor) . PKA существует в цитоплазме в виде гетеротетрамера, состоящего из двух регуляторных и двух каталитических субъединиц. Регуляторные субъединицы заякорены на мембране. При связывании cAMP комплекс диссоциирует, каталитические субъединицы освобождаются и пассивно поступают в ядро. Но здесь-то и присутствует NES-содержащий белок PKI , который, связываясь с каталитической субъединицой, экспортирует ее из ядра, тем самым, ограничивая время ее активного присутствия в этом компартменте ( Mattaj, I.W. and Englmeier, L. 1998 ).