Бескорневое (некорневое) дерево (unrooted tree)

Бескорневое (некорневое) дерево (unrooted tree): филогенетическое дерево с неизвестным или неидентифицированным положением ближайшего общего предка анализируемых таксонов . Некорневое дерево отражает лишь отношения между таксонами. (Дерево называется корневым или заякоренным (rooted), если на нем обозначается общий предок (корень) анализируемых таксонов . Корневое дерево отражает не только взаимоотношения между таксонами, но и гипотетическое направление эволюции).  Пример бескорневого дерева приведен на рисунке d) (в 6.2.).

Число дихотомических бескорневых деревьев для n висячих вершин можно определить по формуле:

        (2n -5) !
Nu = ----------------
     2 n-3   (n-3) !  

Число дихотомических бескорневых деревьев для n висячих вершин равно числу корневых деревьев для n-1 вершин. Число возможных деревьев увеличивается очень быстро, так при n=10 возможны уже 207025 бескорневых дерева и 34459425 корневых. Это делает невозможным построение филогенетического дерева путем простого перебора уже при сравнительно небольших значениях n.