Брэнч сайты
Формирование структуры лариата приводит к тому, что специфическая последовательность внутри интрона непосредственно участвует в механизме сплайсинга. Известно, что делетирование большинства последовательностей внутри интронов не приводит к остановке сплайсинга ( Khoury G., 1979 ). Однако мутации в структуре истинного брэнч сайта (специфического сайта внутри интрона, участвующего в формировании лариата) может приводить к включению дополнительного брэнч сайта. Брэнч сайты эукариот в нормальных и мутантных интронах приведены в таблице . Анализ этих последовательностей показывет, что гомология весьма слаба, что существуют ограничения на расстояние от 3' сайта сплайсинга, не зависисящие от длины интрона (все лежат в пределах 18 - 37 нуклеотидов).
Анализ сплайсинга у мутантов с одной заменой в предпоследнем А брэнч сайта показывает, что формирование лариата может происходить и с нуклеотидом, отличным от А. Из этого следует, что последовательности окружающие TACTAAC бокс являтся более существенными чем А, с которым в действительности происходит формирование брэнч сайта ( Fouser L.A. 1986 , Jacquier A., 1986 ).
