Сплайсинг: использование альтернативных сайтов
Пре-мРНК вируса SV40 может альтернативно сплайсироваться и образовывать две мРНК кодирующие большой Т и малый t антиген используя разные 5' сайты сплайсинга ( рис ). Использование дистального 5' сайта (по отношению к общему 3' сайту ) генерирует большую T мРНК, а ближний 5' сайт (66 нуклеотидов до 3' сайта) дает малую t РНК. Отношение количества этих продуктов варьирует в разных клеточных линиях. Ge и Manley (1990) открыли фактор сплаисинга ASF/SF2 индуцирующий использование ближнего 5' сайта и ингибирующего образование большого T.
Пре-мРНК аденовируса E1A генерирует при альтернативном сплайсинге 9S, 12S и 13S мРНК посредством разрыва трех альтернативных 5' сайтов ( рис ). Замена общего брэнч сайт-3'-района гетерологическим брэнч сайтом и 3' сайтом сплайсинга увеличивает испльзование 12S и 9S 5' сайтов, и уменьшает - 13S сайта ( Ulfendahl 1989 ). Таким образом существует кооперативное взаимодействие отдельных пар 5'-3' сайтов.
Eperon (1993) показал, что выбор различных 5' сайтов зависит от скорости диссоциации U1 мяРНП на этих сайтах и наличия факторов ASF/SF2.
