3'-(акцепторные) сайты сплайсинга
Консенсус 3'-сайтов сплайсинга может быть записан как PynNPyAG|G (таб). Эксперименты показыват, что последовательное уменьшение длины полипиримидинового тракта приводит к уменьшению эффективности сплайсинга in vivo и приводит к использованию дополнительных сайтов в районе других динуклеотидов AG ( Wieringa B., 1984 ). Ситуация с активизацией ложных сайтов при мутациях аналогична ситуации с 5' сайтами сплайсинга ( Fukamaki Y.,1982 ). Однако, эксперименты in vivo не могут дать ответ на вопрос о специфической стадии сплайсинга , в которой участвуют данные сайты.
Эксперименты in vitro показывают, что хотя 3'-сайт и не разрезается до второй стадии сплайсинга, он является необходимым для успешного прохождения первой - разрезания 5'-сайта и формирования лариата . Мутагенезис доказывает, что мутации или делеция динуклеотида AG полностью блокирует сшивку экзонов (вторая стадия) и уменьшает эффективность первой стадии ( Reed R., Maniatis T., 1985 ). Наооборот, мутации полипиримидинового тракта драматически уменьшают эффективность первой стадии. Таким образом, хотя оба участка необходимы для эффективной реакции 5' разрыва и формирования лариата полипиримидиновый тракт по-видимому имеет большее значение, чем динуклеотид AG.
Роль 3'-сайта сплайсинга у дрожжей и млекопитающих различается. Делеция 3' сайта у дрожжей не препятствует первой стадии сплайсинга и если присутствует брэнч сайт TACTAAC, то активизируется ложный 3' сайт при первом AG справа от него ( Langford C.J., 1983 ). У дополнительных (ложных) сайтов дрожжей, последовательность, предшествующая динуклеотиду AG более вариабельна, чем та же у млекопитающих ( Fukamaki Y.,1982 ). Суммируя это говорят, что полипиримидиновый тракт для млекопитающих более существенен, чем для дрожжей.
Мутация 3' сайта сплайсинга дрожжей AG-GC не препятствует разрезанию этого сайта в нормальной позиции, к тому же формирование комплекса сплайсинга в этом мутанте происходит нормально. Этот эффект отсутствует у млекопитающих.
