ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: КЛАСС: ТФ 4.3 MADS-бокс
Класс факторов, содержащих MADS-бокс
В связанных с ДНК димерах белка SRF ( Serum Response Factor ), содержащего MADS-бокс , выявлена структура, образованная бета - нитями, служащая поверхностью, на которой располагаются две альфа - спирали (по одной на каждую субъединицу), контактирующие с ДНК. Эти альфа-спирали располагаются примерно параллельно малой бороздке ДНК в центре распознаваемой последовательности, удовлетворяющей консенсусу CW6GG, где они и формируют основные контакты. В то же время полипептидные цепи, прилегающие к N-концам обеих спиралей, контактируют по большой бороздке ДНК с C/G-фланкирующими нуклеотидами [ Pellegrini L. et al., 1995 ]. В настоящее время эти структурные особенности выяснены только для SRF. Исходя из гомологии последовательностей, в этом классе можно выделить несколько семейств других транскрипционных факторов, которые сгруппированы в соответствии с их биологической функцией:
( 4.3.1 ) - регуляторы клеточной дифференцировки , некоторые из которых (типа MEF2 ) имеют, помимо MADS-бокса, дополнительные консервативные последовательности ( MEF2-боксы )(подсемейства: MEF-2A-D , факторы гомеотических генов , регуляторы дрожжей ; всего 53 фактора);
( 4.3.2 ) - факторы, опосредующие действие внешних сигналов (типа RF ) (два представителя: SRF , RLM1 );
( 4.3.3 ) - регулятор(ы) метаболизма дрожжей.(один представитель: ARG RI ).
Общее число факторов - 57.
