pH-сенсор (pH-чувствительный рибопереключатель)

Локус alx E. coli экспрессируется в щелочных условиях. Перед этим локусом расположен pH-чувствительный рибопереключатель, который в нормальных условиях формирует трансляционно неактивную структуру, а при повышении pH меняет конформацию на трансляционно активную, в результате чего синтезируется бе-лок Alx [ Nechooshtan, 2009 ]. Интересно, что формирование активной структуры происходит исключительно котранскрипционно и требует задержки РНКП на двух паузирующих участках. Было показано, что транскрипция в щелочных условиях значительно увеличивает время задержки РНКП на этих участках, и за время задержки успевает сформироваться "активный" вариант рибопереключателя [ Nechooshtan, 2009 ; Nechooshtan, 2013 ]. Такой же эффект оказывали и другие факторы, увеличивающие время задержки РНКП, например, добавление NusA . Другие примеры зависимости ответа рибопереключателя от скорости движения РНКП по матрице будут рассмотрены в следующем разделе: " Предохранители и рибопереключатели ".

Ссылки: