Идентификация фрагментов ДНК.
Визуализация и идентификация фрагментов ДНК в геле является либо конечным этапом диагностики, либо необходимым элементом дальнейшего анализа. Визуализация фрагментов ДНК после ПЦР осуществляется сравнительно легко. После окончания ПЦР проводиться электрофорез в агарозном геле, после чего гель обрабатывается этидием бромидом , который связывается с ДНК. При УФ-облучении поверхности геля выявляется свечение в красной области спектра.
Разработаны и другие методы окраски ПЦР-фрагментов. Для методов в некоторых вариантов возможна автоматическая регистрация результатов.
Идентификация конкретных фрагментов в геле среди геномной ДНК является более сложной задачей. Из-за больших размеров генома человека после рестрикции образуется настолько большое число рестриктных фрагментов, что агарозный гель после электрофореза и окраски этидия бромидом при УФ- облучении выглядит как более или менее равномерно окрашенная поверхность. Задача же генетики - выявить специфические фрагменты ДНК. Такую задачу решают с помощью блот-гибридизации по Саузерну .
