JHDM2A Деметилаза
Были идентифицированы пять новых деметилаз, которые обладают общей каталитической структурой, отличной от LSD1 и названной JmjC-доменом ( рис. 10.6 ). Ранее было предсказано, что этот домен обладает ферментативной активностью ( Trewick et al., 2005 ). Было обнаружено, что эти новые деметилазы деметилируют разные метильные состояния НЗК9 и H3K36. JHDM1 деметилирует H3K36me1 и H3K36me2 , а JHDM2A деметилирует H3K9me1 и H3K9me2 ( Tsukada et al., 2006 ; Yamane et al., 2006 ). Триметильное состояние этих двух модифицированных остатков удаляется отдельным набором энзимов. JHDM3A и JHDM2A могут действовать как на НЗКЗ6mеЗ , так и на НЗК9mеЗ ( Cloos et al., 2006 ; Fodor et al., 2006 ; Klose et al., 2006 ; Tsukada et al., 2006 ; Whetstine et al., 2006 ). Возможно, вызывает удивление, что существуют ферменты, которые могут одновременно деметилировать активную (например, НЗКЗ6mе) и репрессивную (например, НЗК9mе) метку. Это можно объяснить с помощью обнаруженных данных о том, что метилирование НЗК9 ассоциируется также с активно транскрибируемыми генами ( Vakoc et al., 2005 ). В более классическом механизме энзим JHDM2A рекрутируется с помощью AR к промоторам, где он участвует в активировании транскрипции через деметилирование НЗК9 ( Yamane et al., 2006 ). Структурный анализ JHDM2A показал, что четыре разных домена (JmjN, JmjC, необычный "цинковый палец" и карбокситерминальный домен), объединяясь, образуют каталитический кор. Этими объединившимися доменами формируется глубокая щель, которая требует конформационного изменения в энзиме или субстрате, чтобы приспособить метильную группу для деметилирования. Такой конформационный сдвиг может объяснить специфичность деметилирования ( Chen et al., 2006 ).
