LSD1 Белок
До недавнего времени было неясно, происходит ли в клетке деметилирование лизинов в гистонах. Поиски таких ферментов оказались бесплодными, и имелись данные о том, что метильные группы в гетерохроматиновых районах могут быть весьма стабильными. Открытие LSD1 все это изменило ( Shi et al., 2004 ). Было показано, что этот белок является энзимом, который специфически удаляет метильные группы с НЗК4 ( Shi et al., 2004 ) и участвует в репрессии. Этот энзим действует путем FSD -зависимой окислительной дестабилизации аминометильной связи, что приводит к образованию немодифицированного лизина и формальдегида. Было показано, что LSD1 действует избирательно в отношении активирующей НЗК4 метки, созданной метилированием, и может дестабилизировать только моно- и ди-, но не триметилирование.
Эта деметилаза является частью большого репрессивного белкового комплекса, который содержит также HDACs и другие энзимы. Другие данные позволяют предполагать, что LSD1 может соединяться в комплекс вместе с рецептором андрогена в локусах-мишенях и деметилирует репрессивную гистоновую метку НЗК9mе2, внося вклад в транскрипционную активацию ( Metzger et al., 2005 ).
LSD1 присутствует в ряде различных репрессорных комплексов, и некоторые из них позволяют ему более эффективно деметилировать лизиновые остатки из нуклеосомного гистона НЗ ( M.G. Lee et al., 2005 ; Shi et al., 2005 ). Специфичность LSD1 может изменяться, если он связывается с таким партнером, как рецептор андрогена ( AR ). Комплекс LSD1-AR деметилирует НЗК9 вместо НЗК4 и в этих условиях активирует, а не репрессирует транскрипцию ( Metzger et al., 2005 ). (См. также HKMTs ).
Предполагаемый гомолог LSD1 у Drosophila, SU(VAR)3-3 , облегчает распространение гетерохроматина в эухроматиновые районы во всех испытанных PEV -перестройках.