KIS Белки CHD-комплекса ремоделинга хроматина
Проведенные исследования позволили предположить участие имеющегося у Drosophila kismet (kis) - члена семейства CHD факторов ремоделинга хроматина - в поддержании активного состояния. Подобно brm , mor и osa , kis был идентифицирован в ходе скрининга на экстрагенные супрессоры Рс ; это позволяло предполагать, что он действует антагонистически по отношению к белкам PcG и поддерживает активные состояния HOX -транскрипции ( Kennison and Tamkun, 1988 ). Генетические исследования показали, что kis необходим как дня сегментации, так и для поддержания HOX-транскрипции в ходе развития Drosophila ( Daubresse et al., 1999 ; Therrien et al., 2000 ). Консервативные домены вне АТФазного домена (в том числе бромодомены и хромодомены) вносят свой вклад в функциональную специфичность ремоделирующих хроматин факторов, опосредуя взаимодействия с нуклеосомами или другими белками. BRM и другие АТФазные субъединицы комплексов SWI/SNF содержат единственный бромодомен (белковый мотив, ассоциированный со связыванием определенных ацетилированных гистонов), тогда как KIS-L содержит два хромодомена (белковых мотива, связывающихся с определенными метилированными гистонами) и является, следовательно, более похожим на Mi2 и другие ремоделирующие хроматин факторы, члены семейства CDH . Хотя большие размеры KIS-L (порядка 575 кда) затруднили биохимический анализ этого белка, его последовательность убедительно свидетельствует о том, что он активирует транскрипцию, ремоделируя хроматин.
KIS-L не ассоциирован физически с BRM и хроматографически ведет себя так, как будто бы он находится в другом белковом комплексе ( Srinivasan et al., 2005 ). Однако эти два белка существенно перекрываются друг с другом и с РНК-полимеразой II на политенных хромосомах, что позволяет предполагать, что оба они играют относительно глобальные роли в транскрипции ( рис. 12.7 ) ( Armstrong et al., 2002 ; Srinivasan et al., 2005 ). Утрата функции BRM блокирует относительно ранний этап в транскрипции ( Armstrong et al., 2002 ), тогда как утрата функции KIS-L ведет к снижению уровня элонгации, но не инициации форм РНК-полимеразы II ( Srinivasan et al., 2005 ). Эти открытия заставляют предполагать, что BRM и KIS-L облегчают различные этапы в транскрипции с помощью РНК-полимеразы II, катализируя АТФ-зависимые изменения в структуре или спейсинге нуклеосом. См. " БЕЛКИ trxG, УЧАСТВУЮЩИЕ В АТФ-ЗАВИСИМОМ РЕМОДЕЛИРОВАНИИ ХРОМАТИНА "