SINE ДНК повторы (short interspersed elements)
Длина SINE-элементов составляет 90-400 п.о.
Хорошо изученными повторами класса SINE в геноме человека и некоторых приматов являются так называемые Alu-повторы . длина повторяющейся единицы которых составляет около 300 п.о. Alu- повторы представлены в геноме человека ~106 копиями и в среднем встречаются через каждые 4 т.п.о., составляя ~5% от суммарного количества ДНК. Аналогичные в структурном отношении повторы, названные B1, обнаружены в геноме мышей и под другими названиями описаны у многих млекопитающих.
Также как и гены транспортных РНК эукариот, многие короткие повторы содержат внутренний расщепленный промотор РНК-полимеразы-III . Большинство SINE являются ретропоследовательностями (т.е. их новые копии возникают за счет обратной транскрипции с РНК-матрицы и последующей интеграции в геном). Наиболее известными повторами этого семейства являются Alu-повторы в геноме человека, B1 и B2 семейства в геноме грызунов.
Ссылки:
- Модификации хроматина и ДНК у Arabidopsis, опосредованные RNAi
- Поиск и классификация альфа - сателлитных повторов
- Повторы в эукариотическом геноме
- Диспергированные повторы (SINE, LINE)
- Функциональная значимость избыточной ДНК
- FWA Ген цветковый
- Ретротранспозиция (ретропозиция)
- ДНК: умеренно повторяющиеся последовательности диспергированные (MER)