Ген TAT (тирозинаминотрансферазы)
Gene: [16q221/TAT] tyrosine aminotransferase (tyrosinemia II, Oregon type)
К настоящему времени ген тирозинаминотрансферазы проклонирован и секвенирована кДНК крысы и мыши ( Shinomiya T.,1984 ; Muller G.,1985 ; Grande T.,1989 ).
В 1990 году была опубликована нуклеотидная последовательность гена тирозин аминотрансферазы человека ( Rettenmeier R.,1990 ). На Рис. 8 представлены нуклеотидная и аминокислотная последовательности гена TAT человека.
Ген, протяженностью свыше 10,9 килобаз, состоит из 12 экзонов (A-L экзоны), экзон-интронные сочленения гена представлены в таблице 8 ( Таблица 8 ). Кодирующая часть гена соответствует мРНК из 2754 нуклеотидов. Открытая рамка считывания, ATG инициирующий кодон, расположен в позиции +97 экзона "B" и оканчивается терминирующим кодоном TAG в позиции +1459 экзона "L".
На основе нуклеотидной последовательности была предсказана аминокислотная последовательность пептида из 454 аминокислотных остатков с молекулярным весом 50,4 D ( Rettenmeier R.,1990 ; Seralini G.E.,1995 ). Эти данные согласуются с сообщениями о выделенной очищенной тирозин аминотрансферазe, представляющей собой димер с молекулярным весом 95900 D.
Регуляция экспрессии фермента осуществляется гликокортикоидами , инсулином и глюкагоном путем прямой транскрипционной активации гена. Два глюкокортикоидных элемента ( GRE s), активирующих транскрипцию идентифицированы на расстоянии 2,5 килобаз от транскрипционного инициирующего сайта гена TAT крысы ( Jantsen H.M.,1987). Дополнительная регулирующая область глюкокортикоидной индукции расположена на расстоянии 5,4 килобаз ( Grande T.,1989). Пять консервативных гексануклеотидных последовательностей " TGTTCT" (GRE консенсусы) выявлены в 5'фланкирующей области гена TAT крысы. Однако, только два из них в позиции -2500 (GRE ll и GRE lll) функционально активны (Jantsen H.M.,1987). На Рис. 9 представлена 5' фланкирующая область гена TAT человека.
В 3' нетранслируемой области расположено два сигнала поли- аденилирования (AATAAA) в позиции + 2070 и +2738, но только 3'сигнал функционирует. В 3' нетранслируемой области гена TAT человека расположен Alu элемент в позиции +2131-2481. Alu последовательность включена в направлении, противоположном транскрипции, и на 3'концах несет типичные "A" области, которые интерпретируются как необычные повторы из 18 нуклеотидов (CTTATATTGAACTTCTCT), переписанные со смысловой цепи Alu повтора. Alu повторы фланкированы прямыми повторами из 15 нуклеотидов. Фланкирующий прямой повтор Alu элемента инсерцирован в "L" экзон TAT гена человека. Alu элементы (Alu l и Alu ll) выявлены и в 5'фланкирующей области гена TAT человека в позиции от -1921 до -3520, которые образуют димер, соединяясь голова к хвосту. См. Ген TAT: Регуляторные зоны
