Трансляция: инициаторная тРНК
В качестве инициаторной тРНК , узнающей кодон инициации AUG, служит специальная тРНКf , ацилируемая метионил-тРНК- синтетазой .
Инициаторная тРНК имеет сродство к обычной метионил-тРНК- синтетазе и, соответственно, акцептирует метионин в качестве аминокислоты. Таким образом, в клетке два класса тРНК оказываются ацилированными метионином: обычная тРНК, узнающая только метиониновый кодон AUG при элонгации , и инициаторная тРНК, узнающая кодон AUG в процессе инициации . Следовательно, единственным отличием инициаторной метионил-тРНКf и обычной метионил-тРНКMet являются некоторые особенности структуры самого тРНКf-остатка, которые делают ее способной взаимодействовать с факторами инициации и вакантной рибосомной субчастицей и не способной участвовать в элонгации. Первичные и вторичные структуры этих двух эукариотических тРНК очень похожи ( Simsek M. et al, 1972 ; Gruhl H. et al, 1975 ). Инициаторные тРНК имеют консервативный участок GAUC в положении 51-54. Универсальная последовательность в тех же позициях элонгаторных тРНК содержит T вместо A и псевдоуридин вместо U. В инициаторных тРНК дигидроуридиловая петля не содержит дигидроуридина.