IntI-Интегразы
Интеграза IntI1, кодируемая интегронами 1-го класса, изучена в экспериментальной системе наиболее детально [ Collis, 1992 , Collis, 1993 , Collis, 1998 , Collis, 2001 ]. Было показано, что этот фермент катализирует не только реакции интеграции/эксцизии между attI- и attC-сайтами , но и рекомбинацию между двумя attC-сайтами, а также между вторичными сайтами интеграции и сайтом attC кассеты. Рекомбинационные события такого рода могут эффективно происходить в клетках бактерий, принадлежащих к разным видам.
Интеграза IntI1 узнает как attI1, так и attI2.
Интеграза IntI2, кодируемая интегроном Tn7 класса 2, имеет характерную особенность - внутренний стоп-кодон в аминокислотной позиции 179 [ Hansson, 2002 ]. Мутагенез в стоп-кодоне восстановил активность IntI2, после чего была проверена ее рекомбинационная активность. Оказалось, что она эффективно осуществляет вырезание генных кассет из двух классов интегронов, производя рекомбинацию между attC-сайтами, но не способна проводить рекомбинацию типа attC x attI1, так как она узнает только свой собственный сайт attI2.
Интеграза третьего класса интегронов - IntI3, связывается и осуществляет рекомбинацию в сайтах интеграции всех трех классов интегронов [ Collis, 2002 ].