Clr4 (НЗК9-метилтрансфераза гистонов)
Clr4 создает сайты связывания для хромодоменных белков и, тем самым, прочного сайленсинга.
Обнаружено, что Сlr4 является компонентом мультипротеинового комплекса, который содержит белок Rik1 гетерохроматина, Cullin ЕЗ- убиквитинлигазу и несколько других белков ( Hong et al., 2005 ; Horn et al., 2005 ; Jia et al. 2005 ; Li et al., 2005 ). Далее эти ассоциированные с Clr4 белки усиливают связь между РНК и формированием гетерохроматина. Белок Rik1 является членом большого семейства белков типа beta propeller WD repeat, участие которых в связывании с РНК или ДНК предполагалось. Среди членов этого белкового семейства - фактор CPSF-A (Cleavage Polyadenylation Specificity Factor A), участвующий в сплайсинге пре-иРНК, и белок Ddb1 (DNA damage binding 1), участвующий в связывании с поврежденной УФ ДНК. Особый интерес представляет CPSF-A, поскольку Rik1 сходен по последовательности со своим предполагаемым связывающимся с РНК доменом, участвующим в распознавании последовательностей полиаденилирования иРНК ( Barabino et al., 2000 ). Белок Ddb1, подобно белку Rik1, является компонентом комплекса Cul4-E3-убиквитинлигазы и участвует в распознавании и репарации ДНК, поврежденной УФ ( Higa et al., 2003 ; Zhong et al., 2003 ). Весьма интригующая возможность заключается в том, что Rik1 действует похожим на действие CPSF-A и Ddb1 образом, связываясь во время сборки гетерохроматина с продуктом, произведенным RNAi ( рис. 8.5 ).
Ссылки:
- РНКi и сайленсинг генов, направляемый РНК
- Schizosaccharomyces pombe: центромеры
- Метилирование H3K9
- PEV, формирование гетерохроматина и сайленсинг генов у различных организмов
- Инициация сборки гетерохроматина малыми РНК
- Синтез dsRNA и образование siRNA
- Транскрипция центромерных повторов
- RNAi и сборка гетерохроматина у S. pombe
- Schizosaccharomyces pombe: центромерные внешние повторы
- Зависимость сегрегации хромосом от молчащего хроматина в центромерах
- Модели распознавания РНК-РНК versus РНК-ДНК
- Как RNAi рекрутирует энзимы, модифицирующие хроматин?
- Различные механизмы сайленсинга у грибов