PRE (Polycomb Response Element, "элемент ответа" PcG)
У Drosophila наследуемая репрессия гена требует рекрутирования белковых комплексов PcG к элементам ДНК, называемым "элементы ответа polycomb" (PREs, polycomb response elements, реагирующие элементы Polycomb). Комплексы PcG рекрутируются к генам-мишеням посредством нуклеотидной последовательности ДНК, называемой у Drosophila "Элементом ответа" PcG (PRE, PcG Response Element). Будучи рекрутированы, они устанавливают состояние "молчащего" хроматина, которое может наследоваться в ряду многих клеточных делений.
Нуклеотидные последовательности PRE управляют функцией PcG, и по крайней мере один PRE может действовать как модуль памяти, будучи присоединен к репортерному конструкту, что подчеркивает важность этих последовательностей. Нуклеотидные последовательности, связывающиеся с фактором GAGA , играют важную роль в функционировании PRE, и предполагается, что привязка белка GAGA к ДНК усиливает связывание и функционирование PRC1 ( Mahmoudi and Verrijzer, 2001 ).
Эквивалентные последовательности у млекопитающих установить не удалось. Неясно, каким образом белковые комплексы PcG вызывают протяженный сайленсинг зависимым от PRE образом, потому что PREs обычно локализованы на расстоянии килобаз от сайта старта транскрипции генов-мишеней.
PREs поддерживают сегмент-специфичную экспрессию генов HOX за рамками фазы эмбриональной инициации. PREs привлекают белки PRC1 , будучи интегрированы в эктопические сайты в политенных хромосомах; это позволяет предполагать что они определяют специфичность последовательности для узнавания комплексом PRC1 генов- мишеней и заякоривания на них.
В ходе эволюции PREs оказались на удивление мало консервативными по последовательности. Даже в пределах близкородственных видов Drosophila число, положение и состав PREs существенно варьируют (L. Ringrose and R. Раrо, неопубликовано). Это заставляет предполагать, что требования в отношении последовательности, а также положения PREs являются нежесткими и могут быть адаптированными к видоспецифичным требованиям. Тем не менее, компоненты PRC1 высоко консервативны и предположительно используют тот же самый базовый молекулярный механизм (механизмы) для индукции изменений более высокого порядка в хроматине "молчащих" генов-мишеней.
См. " Нацеливание PRC1 на сайленсированные гены ".
" PcG Белки ".
Ссылки:
- Инактивация X-хромосом и факультативный гетерохроматин
- Теломерный эффект положения у D. melanogaster
- Регуляция сайленсинга у C. elegans
- Гены, поддерживающие детерминированное состояние у Drosophila
- Polycomb и Trithorax: часть I
- Транскрипционный сайленсинг и белки Policomb: общее резюме
- Белки trxG: активаторы или антирепрессоры?
- Предотвращение наследуемой репрессии антисайленсингом
- Транскрипционный сайленсинг и белки Policomb: заключение и перспективы
- Установление репрессивных функций с помощью PRC1
- Инсуляторы: механизм действия, домены независимой транскрипции
- Метилирование H3K27
- Инсулятор scs дрозофилы
- Pc белки (Polycomb): репрессия транскрипции
- BTB-домен белка Мod(mdg4)