Sir2 Белок
Белок Sir2 является деацетилазой гистонов ( Imai et al., 2000 ). Это единственный белок Sir , у которого есть очевидные гомологи у всех других эукариот и который регулирует PEV . Создается впечатление, что этот фермент в основном отвечает за удаление ацетильных компонентов гистонов в "молчащем" хроматине. Кроме того, поскольку этот фермент зависим от NAD , он связывает регуляцию сайленсинга (гетерохроматина) с клеточной физиологией.
Sir2 является прототипом большого семейства НАД-зависимых деацетилаз. Семейство белков Sir2 необычно консервативно и найдено у организмов от бактерий до человека. Его эволюционное древо содержит как ядерные, так и цитоплазматические ветви. Это филогенетическое древо без корня было построено с помощью программ CLUSTAL W(R) и TREEVIEW(R) для сравнения последовательности коровых доменов гомологов, идентифицированных в библиотеках кДНК и уникальных генов. Шесть подклассов и несвязанная группа описаны в работе Фрая ( Frye, 2000 ).
Гомологи млекопитающих обозначены как SirT1-7 жирным шрифтом, а белки почкующихся дрожжей подчеркнуты. Остальные обозначены названием вида ( рис. 4.4 ).
Ссылки:
- В чем же в действительности заключается эпигенетический контроль?
- История эпигенетики: 58 симпозиум Колд Спринг Харбор (часть II)
- Schizosaccharomyces pombe: центромеры
- Синтез dsRNA и образование siRNA
- Репрессивная структура гетерохроматина S. cerevisiae
- Деацетилирование гистонов белком Sir2 у S. cerevisiae
- Ацетилирование гистонов в эухроматине у S. cerevisiae
- HDAC (деацетилаза гистонов, histone deacetylase)
- Sir2 Деацетилирует гистон Н4 по 16-му остатку лизина у S. cerevisiae
- Метилирование H3K79