Арестованные элонгационные комплексы
Популяция элонгационных комплексов (ЭК) РНК-полимеразы (РНКП), возникающих на одном и том же промоторе, неоднородна. Некоторая часть ЭК приостанавливает синтез РНК и находится в состоянии "паузы". Это может происходить из-за особенностей структуры матрицы, отсутствия комплементарного нуклеотида или в результате действия регуляторных факторов. Структура большей части паузирующих комплексов не нарушена и по прошествии некоторого времени (которое может составлять десятки секунд и более) они продолжают синтез РНК. В то же время, часть паузирующих комплексов может переходить в так называемое арестованное (arrested) состояние, в котором они не способны продолжить синтез РНК. По всей видимости, одной из основных причин образования арестованных элонгационных комплексов является смещение РНКП назад по матрице ДНК - backtracking, - в результате чего активный центр теряет контакт с 3'-концом новосинтезированной РНК (см. " Элонгационный комплекс РНК-полимеразы ") ( Komissarova and Kashlev, 1997a ; Komissarova and Kashlev, 1997c ; Krummel and Chamberlin, 1992 ; Nudler et al., 1997 ).