Ca2+ каналы L-типа, субъединица альфа-1

Первичная структура База данных SWISS-PROT

Ген База данных HUGEN

Карта белка канала кальциевого L-типа, субъединица альфа-1

Субъединица альфа-1 (молекулярная масса155-170 кДа) является непосредственно каналообразующим белком и, кроме того, рецептором кальциевых антагонистов дигидропиридиновой , фенилакиламиновой ( верапамил , D-600 ) и бензотиазепиновой ( дилтиазем ) природы ( Tanabe et al., 1987 ; Maelicke, 1988 ; Glossman,Striessnig, 1990 ). С помощью метода определения гидропатического индекса для каждого нонадекапептида в составе полипептидной цепи ( Kyte, Doolittle, 1982 ) было показано, что субъединица альфа-1 состоит из четырех больших доменов, в каждом из которых есть по шесть трансмембранных фрагментов ( рис.54 ). По своей структуре альфа1-субъединица кальциевого канала гомологична соответствующей субъединице потенциалуправляемого натриевого канала . Эти два типа каналов образуют отдельное семейство белков .

При анализе аминокислотных последовательностей альфа1-субъединиц, входящих в состав потенциалуправляемых кальциевых и натриевых каналов, выявлены последовательности, гомологичные EF-руке Ca++-связывающих белков ( Babitch,1990 ). EF-рука кальмодулина и ряда родственных ему белков образована последовательностью из 29 аминокислот, которые образуют альфа-спираль ( Tufty, Kretsinger, 1975 ). Гомологичные EF-руке последовательности обнаружены у всех трех известных первичных структур альфа1-субъединиц кальциевых и у 7 из 8 опубликованных аминокислотных последовательностей альфа1-субъединиц натриевых каналов [Babitch,1990] .

Ни у одной из 10 опубликованных последовательностей калиевых каналов эта структура не обнаружена. Поскольку данная последовательность играет важную роль в функционировании каналов, предполагается, что четыре домена альфа1-субъединиц потенциалуправляемых кальциевых или натриевых каналов образуют псевдосимметричную структуру, прошивающую насквозь липидный бислой. В центре этой структуры, напоминающей цилиндр, находится пора, через которую проходят ионы (см. рис.54 ).

С внутренней стороны эта пора выстилается отрицательно заряженными аминокислотами трансмембранных сегментов S2 . Сегменты S4 ,в составе которых имеются положительно заряженные аминокислоты, аргинин и лизин, по-видимому, выполняют роль сенсора потенциала ( Tanabe et al., 1987 ).

Ссылки: