ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: КЛАСС: ТФ 4.1 домены RHR (гомологичные Rel области)
Класс факторов, содержащих район, гомологичный Rel домену ( RHR , Rel homology region )
К классу (4.1) относятся активаторы и ингибиторы транскрипции. Эти факторы содержат ДНК-связывающие домены типа Rel , а также домены типа анкириновых повторов , обеспечивающие белок-белковые взаимодействия. При этом белки данного класса могут содержать как оба типа доменов одновременно (семейство 4.1.1 ), так и один из них (семейство 4.1.2 ).
При рассмотрении ТФ этого класса встречается уникальный случай, когда один ген кодирует несколько белков с сильно различающейся структурой и функцией. Ген NFKB1 кодирует белок- предшественник NF-kB p105 , содержащий как Rel-домен, так и анкириновые повторы (см. обзор [ Verma I.M. et al., 1995 ]). В результате процессинга этого белка образуется ядерный белок р50 . Он является ДНК-связывающей субъединицей фактора NF kB . В форме гомодимера р50 почти не влияет на транскрипцию, но при гетеромеризации с р65 он становится эффективным транс- активатором транскрипции мРНК. Однако с использованием альтернативного старта транскрипции и нижележащего инициирующего кодона тот же самый ген кодирует другой белок ( IkB-подобный ингибитор ( IkB-гамма ) [ Inoue J.-i. et al., 1992 ].
В классе 3 семейства: 1) Rel/ankyrin-факторы ( NF-kB1 , RelA ; всего 11 факторов); 2) только ankyrin-факторы ( IkBальфа , Bcl-3 ; всего 8 факторов), 3) NF-AT (6 факторов). Общее число факторов - 25.
