Ген коагуляционного фактора IX
Ген фактора IX локализуется на дистальном конце длиного плеча X-хромосомы в позиции Xq 28 ( Patterson M.N.,1987 ; Patterson M.N.,1989 ; Mandel J.L.,1989).
Работы по клонированию кДНК фактора IX человека были опубликованы в 1982-1983 годах (Kurachi K.,1982 ; Choo K.H.,1982 ; Jaye M.,1983). Однако, при сравнении секвенированных нуклеотидных последовательностей было выявлено пять отличий. В 1984 году была опубликована полная нуклеотидная последовательность мРНК фактора IХ ( Anson D.S.,1984 ), а в 1985 году - нуклеотидная последовательность гена фактора IХ ( Yoshitake S.,1985 ). Нуклеотидная и аминокислотная последовательности гена фактора IХ человека представлены на Рис. F 9 seq .
Ген фактора IX (F IX) состоит из 8 экзонов (a - h) и 7 интронов (a - g), что составляет по протяженности 33,5 килобаз. На долю интронов приходится 92-95% длины гена. Экзон-интронные сочленения гена представлены в Таблице F 9 int.
В гене фактора IХ выявлено несколько Alu повторов. Один Alu элемент локализуется в интроне А, три Alu элемента локализуются в интроне F, пятый Alu элемент расположен в 3' фланкирующей области гена. Кроме Аlu элементов в гене фактора IX встречаются повторы Kpnl (в интроне D и 5' фланкирующей области гена) и HindIII повторы в 5' фланкирующей области гена ( Yoshitake S.,1985).
мРНК гена фактора IX состоит из 2802 пар оснований, включая 29 пар оснований в 5'некодирующей области и 1390 пар оснований в 3'некодирующей области, исключая поли-А конец ( Anson D.S.,1984 ).
Первые два экзона гена фактора IX кодируют препролидерную (prepro leader) последовательность, которая удаляется в процессе биосинтеза одноцепочечного полипептида. Остальные экзоны кодируют полипетид из 415 аминокислотных остатков, которые образуют зрелый протеин, циркулирующий в плазме крови человека.
8 экзонов гена фактора IX кодируют 6 больших доменов фактора IX:
1. Экзон "a" - гидрофобный сигнальный пептид, который обеспечивает секрецию протеина из гепатоцита в кровь.
2. Экзоны "b" и "c" - пропептид и " gla" домен , который содержит 12 гамма карбоксиглутаминовых остатков. Данная посттрансляционная модификация обеспечивает правильное сворачивание цепи и связывание ионов кальция фактором lX.
3. Экзон "d" - тип В или первый домен, схожий с эпидермальным фактором роста ( EGF ). Данный домен содержит консервативную последовательность карбоксилатных остатков, включая бета гидроксиаспартат в положении 64. Данный домен обеспечивает дополнительное связывание ионов кальция.
4. Экзон "e" - тип А или второй домен, схожий с эпидермальным фактором роста (EGF), который утрачивает консервативную последовательность домена А.
5. Экзон "f" - активный (коагуляционный) домен, который дважды расщепляется фактором XIa, переводя фактор IX в IXа.
6. Экзоны "g" и "h" - сериновая протеаза или каталитический домен, ответственный за протеолиз фактора Х в Ха.
Gene: [0Xq271/F9] coagulation factor IX (plasma thromboplastic component); hemophilia B
