Число сверхвитков ДНК

Число сверхвитков,D Lk (или t) - количественная характеристика сверхспирализации молекулы ДНК, определяющая многие ее свойства; этот параметр определяется как

D Lk = Lk - n/g (1), где Lk - порядок зацепления , n - контурная длина молекулы ДНК, g  - количество нуклеотидов, приходящееся на один виток двойной спирали ДНК. Из этого определения следуют два вывода:

1. Величина D  Lk не является топологическим инвариантом, а зависит от условий в растворе, которые определяют гамма. И хотя сама g  меняется очень незначительно при изменении внешних условий, эти изменения могут существенно менять значение  D  Lk, так как в соотношении (1) в правой части стоит разность двух больших близких по значению величин.

2. Порядок зацепления Lk по определению является целой величиной, а N/g не должна быть целочисленной. Следовательно, не является целочисленной и величина  D Lk. Однако набор значений D  Lk, которые может иметь кольцевая замкнутая ДНК с заданной химической структурой, всегда представляет собой арифметическую прогрессию с единичной разностью. Это следует из того факта, что для любых заданных условий все изменения в D Lk могут быть связаны лишь с изменениями в Lk , поскольку величина N/g для всех молекул одинакова.

Ссылки: