Rap1p белок дрожжей

RAP-1 белок дрожжевых клеток является жизненно-необходимым ДНК-связывающим белком, регулирующим многие функции, включающим транскрипцию (активацию и репрессию), рекомбинацию и репликацию ( Gilson, 1989 ). Места связывания RAP-1 найдены среди репрессорных последовательностей в ДНК, совместно с другими сайтами необходимыми для поддержания зарепрессированного состояния промотора. Вероятно белок Rap1 может активно конкурировать с нуклеосомами за связывание с ДНК и тем самым нарушать кооперативное распространение компактного хроматина. Интересно, что одиночный RAP-1 сайт служит для активации транскрипции ( Gilson,1989 ). Анализ структуры дрожжевых хромосом указывает на то, что RAP-1 белок участвует в образовании петель ДНК в окрестности локуса скрещивания ( Hofmann et al, 1989 ). Эксперименты в системе in vitro подтверждают эти представления (Hofmann et al, 1989 ). Детали механизмов многочисленных эффектов этого многофункционального белка неизвестны, но очевидно, что образование петель в ДНК, опосредованное этим белком, является неотъемлимым признаком его активности.

Raplp играет центральную роль в ТЭП , регуляции длины теломеры и сайленсинге . Мутагенез продемонстрировал, что 28 С-концевых аминокислот Raplp критичны для ТЭП, регуляции длины теломеры и сайленсинга HML [ Liu, ea 1994 ]. Поскольку Raplp способен как активировать, так и репрессировать транскрипцию в зависимости от контекста его сайта связывания, этот белок должен действовать вместе с другими факторами. Для объяснения его действия на НМ-сайленсерах и теломерах было предположено что Raplp посредством белок-белкового взаимодействия привлекает в комплекс с ДНК белки Sir [ Cockell, ea 1995 , Hecht, ea 1996 , Moretti ea 1994 ]. В двухгибридной системе было продемонстрировано, что Sir3p и Sir4p взаимодействуют с Raplp. Взаимодействие Raplp-Sir3p, по-видимому, прямое и похоже, что Sir3p и Sir4p сами образуют белковый комплекс [ Moretti ea 1994 ]. Одна из возможных функций такого взаимодействия - это образование расширяющейся структуры, вовлеченной в распространение репрессированного состояния хроматина от сайта его инициации [ Shore, ea 19Sh ].

Ссылки: