Ген бета-глобина

Gene: [11p155/HBB] hemoglobin, beta;

GenBank: g455025

Ген бета-глобина человека локализуется на 11 хромосоме в позиции p15.5.

Кластер бета-глобиновых генов занимет участок ДНК в 65 тысяч пар нуклеотидов ( Fritsch E.F.,1980 ). Пять бета-глобиновых генов расположены по ходу транскрипции в последовательности, в которой данные гены экспрессируются по мере развития организма. Вначале локализуется эмбриональный - эпсилон-глобиновый ген, следом за ним через 13,3 тысяч пар нуклеотидов расположены два фетальных гамма-глобиновых гена (гамма-G и гамма-A) на расстоянии 3,5 тысяч пар нуклеотидов друг от друга. Вышележащие гены отделены от генов взрослых (дельта и бета) 13,9 тысячами пар нуклеотидов. Дельта-глобиновый и бета-глобиновый гены отделены друг от друга 5,4 тысячами пар нуклеотидов.

В этом кластере выявлены еще 2 пседогена, функционально неактивных. Один псевдоген локализуется перед 5' концом эпсилон-глобинового гена - на расстоянии 6-9 тысяч пар нуклеотидов, второй псевдоген - в промежутке между гамма-A-глобиновым геном и дельта-глобиновым геном.

В 1974-1985 годах были проведены работы по определению нуклеотидных последовательностей:

1) бета-глобинового гена ( Forget B.G.,1975 ; Marotta C.A.,1974 ; Marotta C.A.,1977 ; Lawn R.M.,1978 ; Lawn R.M.,1980 ; Kaufman R.E.,1980 ; Proudfoot N.J.,1976c ; Moschonas N.,1981 ; Carlson D.P.,1983 ; Poncz M.,1983 ; Hattori Y.,1985 ; Grindlay G.J.,1984 ; Orkin S.H.,1984b ; Fritsch E.F.,1980 ; Efstratiadis A.,1980 )

2) эпсилон-глобинового гена ( Proudfoot N.J.,1979 ; Proudfoot N.J.,1976a ; Proudfoot N.J.,1976b ; Baralle F.E.,1980a ; Baralle F.E.,1980b ; Baralle F.E.,1980c ; Di Segni G.,1981 ; Alan M.,1982 ; Alan M.,1983 ; Li Q.,1985 )

3) гамма-глобиновых генов ( Slightom J.L.,1980 ; Cavallesco C.,1980 ; Kaufman R.E.,1980 ; Grindlay G.J.,1984 ; Powers P.A.,1984 ; Gelinas R.,1985b )

4) дельта-глобинового гена ( Lawn R.M.,1978 ; Lawn R.M.,1980 ; Spritz R.A.,1980 ; Poncz M.,1983a ; Kaufman R.E.,1980 ; Grindlay G.J.,1984 )

5) псевдогенов ( Shen S.H.,1981 ; Miyamoto M.M.,1987 )

Все бета-глобиновые гены построены по одному образцу - имеют 3 экзона и 2 интрона. Малый интрон (120-130 пар нуклеотидов) локализуется между 30 и 31 кодонами, большой интрон (800-900 пар нуклеотидов) локализуется между 104 и 105 кодонами. Локализация интронов в строго определенных местах характерна для всей группы бета-глобиновых генов (Lawn R.M.,1978). Кодирующая часть бета-глобиновых генов достигает 438 пар нуклеотидов; общая длина гена, включая кодирующую и некодирующую области - 1600 пар нуклеотидов.

Нуклеотидная и аминокислотная последовательности бета-глобинового гена человека представлены на  Рис. Hb B seq , эпсилон-глобиного гена на  Рис. Hb эпсилон seq, гамма-глобинового гена на Рис. Hb гамма seq, дельта-глобинового гена на  Рис. Hb дельта seq.

Метилирование одиночных CpG-динуклеотидов

Ссылки:

Все ссылки