mutY ген E.coli

Ген mutY расположен на 66,8мин. хромосомы E.coli [329] и находится на 5'-конце полицистронного оперона, включающего 4 ORF: mutY, yggX , mltC и nupG [ Gifford, ea 1999 ]. Оперон содержит несколько промоторов, в том числе 2 промотора с 5'- стороны гена mutY и промотор генов yggX-mltC, находящийся непосредственно в кодирующей последовательности гена mutY [ Gifford, ea 1999 ].

Этот последний промотор регулируется системой SoxRS , однако она не оказывает никакого влияния на экспрессию гена ДНК-гликозилазы. Белок Eco-MutY представляет собой полипептид длиной 350а.к.о. с расчетной ММ 39149Да, гомологичный белку Nth [ Michaels, ea 1990 ].

У MutY сохраняются мотивы HhH и GPD, а также FeS-кластер. Однако в состав белка MutY входит дополнительный протяженный C-концевой участок, отсутствующий Nth . По вторичной и третичной структуре он близок к пирофосфатазам семейства NUDIX , хотя гомология на уровне последовательности довольно низка [ Noll, ea 1999 ]. Еще одно важное отличие MutY от Nth заключается в том, что остаток Lys120, находящийся в мотиве HhH и имеющий критическое значение для AP- лиазной активности Nth, у MutY заменен остатком Ser.

Система защиты ДНК от окисления гуанинов у E. coli

Ссылки: