CFTR Ген белка-регулятора мембранной проводимости хлорных каналов
Ген CFTR (Gene: [07q312/CFTR] cystic fibrosis transmembrane conductance regulator) - ген трансмембранного регуляторного белка CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductase regulator).
Ген CFTR человека локализуется на 7 хромосоме в позиции q31.2. Мутации гена приводят к наследственному заболеванию муковисцидозу.
Исследования по идентификации, клонированию и секвенированию гена CFTR были проведены в 1989-1991 годах ( Kerem B.,1989 ; Riordan J.R.,1989 ; Rommens J.M.,1989 ; Dean M.,1988; Zielenski J.,1991b ). Размер гена порядка 250500 пар нуклеотидов; ген разбивается на 27 экзонов. Величина экзонов варьирует от 38 до 724 нуклеотидов; значение интронов колеблется от 1100 до 40000 нуклеотидов. Экзон-интронные сочленения CFTR-гена представлены на Рис. CFTR int.
Зрелая матричная мРНК состоит из 6500 нуклеотидов, кодирующих полипептидную цепь трансмембранного регуляторного белка из 1480 аминокислотных остатков. Белок состоит из 12-ти мембрансвязывающих областей и 2-х АТФ-связывающих доменов.
Экспрессия гена ограничена в основном эпителиальными клетками эндокринных желез (слюнных, поджелудочной и потовых), а также клетками в кишечнике и семенниках. В эпителии легких ген функционирует слабо.
В промоторной области гена вместо характерных TATA-box и CAAT-box последовательностей идентифицированы обогащенные GC-последовательности, SP1- и AP1-сайты.
В гене CFTR выявлены короткие и длинные повторы. Четыре из пяти Alu повторов, локализованных в 2, 8, 14а, и 23 интронах, расположены в ориентации транскрипции гена. Пятый Alu- повтор, локализованный в интроне 6а, располагается в противоположной ориентации. Один Kpn-повтор локализуется в 5'-конце 16 интрона по ходу транскрпиции гена. Кластеры динуклеотидных повторов (CA/GT) локализуются в 8 и 17b интронах.
Нуклеотидная и аминокислотная последовательности гена CFTR представлены на Рис. CFTR seq.
Ссылки:
- ABC-Белки (ABC-транспортеры, суперсемейство транспортных белков ABC)
- Маркерные генотипы
- Болезни экспансии: потеря функции генов при миотонической дистрофии
- Муковисцидоз (кистозный фиброз): общие сведения
- Экспрессия трансгенов: тканеспецифичность
- Гены-триггеры мультифакториальных заболеваний: введение
- Анализ гетеродуплексов (HA) метод для поиска мутаций
- Моделирование муковисцидоза
- Муковисцидоз: диагностика
- mEPOX ген и заболевания легких
- Ген CFTR: мутации
- Мутагенез: эндогенные механизмы: общие сведения
- Электрофорез в полиакриламидном или агарозном гелях
- ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ МУКОВИСЦИДОЗА