МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ РАЗНООБРАЗИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ СНЕГА АНТАРКТИДЫ

Характеристика районов исследования Антарктиды

Методика отбора микробиологических проб в районах Антарктиды

Первичная обработка микробиологических проб

ДНК и РНК экстракция

Разнообразие микроорганизмов: реакция обратной транскрипции

Разнообразие микроорганизмов: ПЦР

Разнообразие микроорганизмов: праймеры для ПЦР

Разнообразие микроорганизмов: электрофорез в агарозном геле

Очистка фрагментов ДНК из агарозного геля

Конструирование библиотеки клонов гена 16S рРНК

Приготовление химически компетентных клеток E. coli

Трансформация компетентных клеток E. coli

Питательные среды

Подсчет численности микроорганизмов

Измерение включения радиоактивно меченных тимидина и лейцина в клетки

Разнообразие микроорганизмов: секвенирование ДНК фрагментов

Предварительная обработка прочтений при секвенировании

Разнообразие микроорганизмов: филогенетический анализ

Разнообразие микроорганизмов: функциональный анализ

Внешние источники метагеномных данных

Поиск последовательностей CRISPR-Cas

Анализ последовательностей спейсеров в CRISPR локусах

Разнообразие микроорганизмов: статистический анализ

Ссылки: